Кластеры Beowulf в ЦКОХИ

Ресурсы создаются в рамках проекта РФФИ 04-07-90220

В ЦКОХИ было построено 4 кластера, из них в настоящее время эксплуатируются 2. Суммарная пиковая производительность вычислительных ресурсов ЦКОХИ составляет около 80 GFLOPS.
  1. Кластер на основе 64-разрядных микропроцессоров Opteron
    Нами построен экспериментальный кластер на базе 64-разрядных х86-совместимых микропроцессоров - AMD Opteron 242 /1.6 ГГц, Opteron 244 /1.8 ГГц и Opteron 246 /2.0 ГГц. Эти процессоры обеспечивают возможность эффективно работать с двухпроцессорными SMP-конфигурациями узлов кластера благодаря тому, что каждый микропроцессор имеет собственную шину в оперативную память (чего не имеет место для SMP-узлов на базе Intel Xeon/Pentium 4). Применение 64-разрядных микропроцессоров позволяет химическим приложениям использовать более чем 2 Гбайт оперативной памяти, что актуально для ряда методов квантовой химии.

    В качестве стандартных каналов связи узлов данного кластера сейчас используется InfiniBand 4x и Gigabit Ethernet. Инсталлировано 8 двухпроцессорных узлов на базе материнских плат Tyan S288x и Supermicro H8DCE. В узлах используется двухканальная память DDR333 емкостью 2 Гбайт на узел, а в двух из них - по 4 Гбайт.

    В кластере установлены компиляторы с языков Fortran 77 и 95 (Pathscale-2.4, g77-3.3, Intel ifc-7.1, ifort-8.1 и 9.1, Portland Group pgf77-5.1 и pgf90-5.1) и High Performance Fortran (pghpf-5.1). Все эти оптимизирующие компиляторы, кроме ifc-7.1, способны генерировать 64-разрядный код. Компиляторы Intel, Pathscale и Portland Group имеют средства распараллеливания OpenMP. Доступны математические библиотеки времени выполнения Intel MKL (32-разрядная), AMD acml, Atlas и Goto. Установлены средства распараллеливания MPI (LAM MPI, MPICH, mvapich) и PVM.

  2. Кластер на базе Gigabit Ethernet.
    Два двухпроцессорных SMP-узла на базе Intel Pentium III Tualatin/1266 МГц (кэш L2 емкостью 512 Кбайт) и серверных плат Tyan Thunder (c дополнительными встроенными контроллерами Fast Ethernet; шины PCI 64-разрядные, частота 66 МГц). Емкость оперативной памяти (двухканальная PС133) - 1 Гбайт на узел.

    Два двухпроцессорных SMP-узла на базе AMD Athlon MP1800+ c серверными материнскими платами Tyan Tiger S2460 (набор микросхем AMD 760MP, шины PCI 64-разрядные, с частотой 33 МГц). Емкость оперативной памяти (ВВК266) - 1 Гбайт на узел.

    Два двухпроцессорных SMP-узла на базе AMD Athlon MP1900+ c серверными материнскими платами Tyan Tiger S2460/S2466 (набор микросхем AMD760MP/MPX, шины PCI 64-разрядные, с частотой 33/66 МГц). Емкость оперативной памяти (DDR266) - 1 Гбайт на узел.

    Сетевые 64-разрядные платы Intel Pro100T(1000BaseT), 6-портовый коммутатор Intel NetStructure ES470T. ОС : RedHat Linux 7.2. Инсталлирован компилятор ifc версии 6.0, библиотеки MKL и Atlas. Основные средства распараллеливания - Linda 6.2, LAM MPI и OpenMP.

  3. Кластер на базе 2-канальных соединений (channel bonding) Fast Ethernet.
    Коммутатор D-Link DES3224 (24 порта Fast Ethernet). 8 узлов с микропроцессорами Intel Pentium III/600 MHz (кэш L2 емкостью 512 КБайт, набор микросхем 440BX, материнские платы ASUS P3B-F, оперативная память ECC PC100 емкостью 256 МБайт/процессор). 2 из этих узлов - двухпроцессорные (платы P2B-D), остальные - однопроцессорные. В узлах использованы адаптеры Fast Ethernet различных фирм ( http://www.osp.ru/os/2001/07-08/017.htm ), главным образом Intel EtherExpress Pro. ОС: Linux RedHat6.2. Инсталлированы лицензионные компиляторы: PGI f77 3.1, Lahey LF95 v.6.0. Основные средства распараллеливания LAM MPI, OpenMP. В настоящее время выведен из эксплуатации.

  4. Кластер на основе Fast Ethernet.
    4 однопроцессорных узла на базе AMD Athlon/700 MHz (кэш L2 емкостью 512 КБайт), платы Gigabyte GA-7VX, 128 МБайт ECC PC133 на узел. Cетевые платы Intel, 4-портовый коммутатор от 3Com. ОС: RedHat Linux 7.1. В настоящее время выведен из эксплуатации.

    В настоящее время в кластере проводятся исследования производительности на различных тестах. Для проведения расчетов на этом кластере обратитесь по адресу.