ЦКП Центр компьютерного обеспечения химических исследований РАН
1. Лаборатория (Центр) компьютерного обеспечения химических исследований на базе Института органической химии имени Н.Д. Зелинского Российской академии наук (ИОХ РАН). Адрес ЦКП: 119991, ГСП-1, Москва, Ленинский проспект, 47, тел. 135-41-33, факс 135-53-28, e-mail: request@free.net
Руководитель ЦКП д.х.н. Мендкович Андрей Семенович, адрес: 119991, ГСП-1, Москва, Ленинский проспект, 47, тел. 135-88-24, факс 135-53-28, e-mail: asm@free.net
2. Год создания ЦКП - 1991, решение Бюро ООТХ АН СССР от 21.01.91г.
3.Области исследований: развитие методов расчета электронной структуры и технологий высокопроизводительных вычислений для решения задач химии. Проведение расчетов молекулярных систем методами квантовой химии, молекулярной механики и молекулярной динамики.
Развитие технологий информационного обеспечения и профессиональных коммуникаций для химических исследований, а также инфокоммуникационных систем для обеспечения деятельности территориально распределенных научных коллективов.
4. В состав ЦКП входит телекоммуникационная система, состоящая из узла маршрутизации и опорной сети с использованием маршрутизаторов фирмы Cisco Systems, коммутаторов Gigabit Ethernet фирмы Optical Access, мультиплексоров фирмы RAD Data Communication Ltd., коммутатора АТМ фирмы FORE SYSTEMS, серверов SUN Microsystems и др.
Вычислительные ресурсы ЦКП включают два Linux-кластера - на базе межсоединения Gigabit Ethernet и на базе межсоединений Infiniband 4x плюс Gigabit Ethernet. В первом используются 32-разрядные микропроцессоры x86 (AMD Athlon, Intel Tualatin), во втором - 64-разрядные микропроцессоры AMD Opteron. Cуммарная пиковая производительность вычислительных ресурсов - около 80 GFLOPS.
Информационные ресурсы ЦКП
включают, в частности, национальный Web-cервер по химии (http://www.chem.ac.ru) и базу данных
результатов квантовохимических расчетов с Web-интерфейсом.
Все оборудование находится на балансе ИОХ
РАН.
5. Подключение к телекоммуникационной системе возможно для государственных учреждений, ведущих научные исследования. Обслуживаются научно-образовательные сети из 14 регионов.
Вычислительные ресурсы ЦКП
бесплатно предоставляются всем институтам ОХНМ РАН из любых регионов РФ, а также
владельцам грантов РФФИ по химии, нуждающимся в проведении
высокопроизводительных вычислений для задач молекулярного моделирования.
Удаленный доступ к вычислительным ресурсам осуществляется через
Internet. Требования к оформлению заявок и правила использования
ресурсов доступны на сайте http://www.chem.ac.ru/SCC/MAIN.ru.html .
6. Результаты проведенных расчетов направляются пользователям через Internet.
7. C использованием вычислительных ресурсов ЦКП выполнялись, в частности, следующие химические исследования:
«Исследование физико-химическими методами закономерностей региоселективного моновосстановления полинитроароматических соединений в соответствующие нитросоединения» (ИОХ РАН, ЯрГУ, грант ОХНМ РАН);
«Микроскопические механизмы структурных трансформаций в кристаллах гибкоцепных полимеров» (ИХФ РАН, грант РФФИ);
«Применение 3D-QSAR для изучения ингибиторов HT-рецептора ДНК-метаболитов (противоопухолевых средств), ингибиторов МАР р38-киназы» (Челябинский ГУ, ИОХ РАН);
«Квантовая химия электронно-возбужденных состояний: поли-пиридиновые комплексы переходных металлов» (НИИ химии СПбГУ, грант РФФИ);
«Сжатые атомы: электронная структура, энергетика, реакционная способность» (ИОНХ РАН, грант ОХНМ РАН);
«Многомерная туннельная динамика нежестких молекул и реактивных комплексов» (ИПХФ РАН, Черноголовка, грант РФФИ);
«Фотоиндуцированная генерация оксида азота на основе комплексов переходных металлов» (НИИ химии СПбГУ, грант РФФИ).
ЦКП участвовал в обеспечении управления полетом орбитальной станции «Мир» в 1994-2001гг. и ряде крупных международных инфокоммуникационных проектов. Некоторые публикации результатов исследований на базе ЦКП:
A.S.Mendkovich, "Current Tendencies in the Russian Academic and Research Networks. Developent and the national and regional levels.", in "Visionary Ideas for Visionary Future", CEENet Editions, Tartu,Vienna, Scopje, 1998, pp.157-170
А.S.Mendkovich e.a., "GLOBAL360/NICE videoconference model", in "Multimedia Internet broadcasting", Ed. by Andy Slown and D. Lowrence, Springer-Verlag, London Limited, 2001, pp. 73-92
М.Б.Кузьминский, А.С.Мендкович, "Измерение производительности х86-совместимых компьютеров в ОС Linux", Открытые системы, N9, 2002, c.10-18
Anikin N.A. e.a., "A novel method based on Integral Transformation to Localized Basis Orbitals (ITLBO) for nonempirical calculation of large molecules", J. Comput. Chem., v.24, 2003, p.1132-1141